Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20517G3UVU6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms