Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm5893-201ENSMUST00000135286 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm37110-201ENSMUST00000192993 1628 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm44183-201ENSMUST00000203964 1628 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Dnttip2-201ENSMUST00000035776 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mpp2-202ENSMUST00000100398 3577 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Npy4r-201ENSMUST00000052164 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Lif-201ENSMUST00000040750 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Hacl1-201ENSMUST00000022437 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Vps11-201ENSMUST00000034644 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms