Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms