Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc175E9PVB3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms