Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Phf11bB4XVQ1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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