Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms