Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usf3B2RUQ2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usf3B2RUQ2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usf3B2RUQ2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usf3B2RUQ2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usf3B2RUQ2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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