Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms