Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CadB2RQC6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms