Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms