Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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