Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf394Q9Z1D9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms