Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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Vax2Q9WTP9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vax2Q9WTP9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vax2Q9WTP9 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Vax2Q9WTP9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vax2Q9WTP9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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