Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Map1aQ9QYR6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Map1aQ9QYR6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms