Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms