Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms