Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdcQ9QW08 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdcQ9QW08 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms