Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mid2Q9QUS6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms