Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms