Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr5Q9JLF7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr5Q9JLF7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr5Q9JLF7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms