Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FancaQ9JL70 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FancaQ9JL70 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms