Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin1Q9JKF6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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