Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms