Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms