Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim54Q9ERP3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms