Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms