Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hmgn3Q9DCB1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmgn3Q9DCB1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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