Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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