Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csnk1dQ9DC28 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms