Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TrmuQ9DAT5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrmuQ9DAT5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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