Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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