Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp12Q9D9M2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms