Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgap3Q9D8S3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms