Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms