Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H2al3Q9D4U4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms