Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syce1Q9D495 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syce1Q9D495 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Syce1Q9D495 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Syce1Q9D495 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Syce1Q9D495 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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