Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Snx29Q9D3S3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx29Q9D3S3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx29Q9D3S3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx29Q9D3S3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx29Q9D3S3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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