Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrnp35Q9D384 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms