Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms