Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms