Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Chchd2Q9D1L0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chchd2Q9D1L0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms