Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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