Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms