Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms