Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc47Q9D024 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms