Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms