Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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