Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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