Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms