Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms